Az épületet 1884. május 25-én szentelték fel, és adták át, mint evangélikus elemi iskolát. Az épület mind a négy sarkához később újabb épületeket építettek, elsősorban a családok számára, de ide építették a paplakot is. 1945-ben óriási vérveszteség érte az evangélikus gyülekezetet, hiszen a kitelepítések miatt a gyülekezet nagy részének el kellett hagynia otthonát. 1947-ben, az egyházi tulajdonok államosítása idején, a kommunista párt nyomására az épületet eltulajdonította a magyar állam. A Bünker közben lévő iskola azonban ekkor még csak a fenntartóját és a hitre való nevelési lehetőségét veszítette el, mert Zrínyi Miklós Leányiskola néven tovább folytatódott itt az elemi oktatás. Azonban az iskolát néhány év múlva összevonták több másik iskolával, így ez az épület elveszítette oktatási funkcióját. Ekkor a Soproni Bíróság még a Lackner Kristóf utcában működött, egészen a negyvenes évek végéig, de a felújítási munkák miatt el kellett költözniük, így az üresen álló evangélikusok épületére esett a választás. Ez hosszú távú döntésnek bizonyult, hiszen egészen 2011-ig ez az épület adott otthont a Soproni Városi Bíróságnak, majd a Soproni Járási Bíróságnak.

Az evangélikus gyülekezet 1990-től, a kárpótlások idején kezdte el visszakérni az elvett épületeit a magyar államtól. Először a Templom utca 12. számú ingatlant kapta vissza, majd a Bünker köz többi épületét is. A folyamat 2011-ben fejeződött be, amikor döntés született az épület visszaadásáról.  A hosszas huzavona a bíróság elhelyezése miatt volt, amit végül sikerült megoldani, így a Soproni Evangélikus Egyházközség visszakaphatta legszebb és legértékesebb épületét.

Az épület átalakítása és használatának újraértelmezése folyamatban van. Az épület egy közösségi tér lesz, melyet a gyülekezet tagjai vehetnek majd igénybe. Az épület három fő funkciót kíván betölteni: gyülekezeti hely, könyvtár és levéltár. Az épület legszebb része korábban a díszterem volt, amit a bírósági funkció miatt hat irodára osztottak fel, és most ennek a visszaállítására törekednek, hogy itt ismét egy nagy gyülekezeti, közösségi hely lehessen. Tervben van továbbá a levéltár és könyvtár kialakítása, ami jelenleg - sanyarú állapotban - a Templom utca 12. szám alatt az egyik lakásában lett ideiglenesen elhelyezve. A könyvtár kialakítása már csak azért is fontos, mivel itt olyan unikum könyvek vannak, amik egyedül itt lelhetők fel az országban. Elsődleges szempontjuk, hogy az itt fellelhető anyagok közkinccsé és kutathatóvá váljanak a kutatók, és a történészek számára. Az épület homlokzatának felújítására és nyílászárók cseréjére pályázatot nyújtottak be. Az épület megnyitására legkorábban az épület 130 éves jubileuma alkalmából, 2014. május 25-én, de legkésőbb a reformáció napján 2014. október 31-én kerülhet sor.